一、方舟子与肖传国结怨，始于2000年底，起因是肖传国反对方舟子到洋人那里告中国人的洋状。从那以后，方舟子就一直称肖传国（笔名“昏教 授”）为骗子。2001年7月，肖传国发表《对方舟子“学术打假”的反思及批评》一文，揭露方舟子以假打假、以打求名的“打假”实质。2001年10月， 肖传国实名向《科学》杂志社举报方舟子抄袭该刊发表的文章。这使方舟子对肖传国的仇恨达到了顶点。（见本书第一章《结怨》） 

二、2001年8月，方舟子在新语丝上发布“通缉令”，通缉肖传国。《科学》抄袭案爆发之后，方舟子再次发布“通缉令”。他多次怂恿、指使、号召自己的徒众通过跟踪网络IP等手段查找昏教授的身份。（见本书第二章《陷害》） 

三、2003年初，方舟子以为中国科大特聘教授姚雪彪是昏教授，于是率领众人对姚雪彪大打出手。在得知姚雪彪不是昏教授之后，又突然住手。（见本书第二章《陷害》） 

四、2005年9月，在得知昏教授是纽约大学教授肖传国之后，方舟子不仅怂恿徒众对肖传国进行无情攻击，肆意辱骂，他自己还化名“水中划”发表系列文章，对肖传国进行全面的诬陷和诽谤。（见本书第二章《陷害》） 

五、主要是根据他自己的化名、匿名诽谤文章，方舟子在2005年9月21日的《北京科技报》上实名公开诽谤肖传国。方舟子此举遭到肖传国提出名誉权控诉。武汉市江汉区法院在2006年7月宣判原告胜诉。武汉市中级法院在2007年2月做出终审判决，维持原判。 

六、从肖传国在武汉起诉开始，一直到终审判决，方舟子及其控制的新语丝一直没有停止对肖传国本人的辱骂。这些辱骂还涉及到肖传国先生的导师、年逾九旬的中科院院士裘法祖，以及主审法官吕瑛。（见本书第四章《啸聚》） 

七、在初审失败之后，方舟子一方面在新语丝网站继续对肖传国和武汉法官的辱骂、诽谤，一方面炮制《海内外知识分子关于肖传国诉方舟子案的公开 信》，以造成自己得道多助的舆论。大量事实证明，那封公开信是方舟子一手策划的骗人黑信，许多签名人或者子虚乌有，或者毫不知情，或者本身就是骗子，甚至 是在押犯罪嫌疑人。（见本书第四章《啸聚》） 

八、方舟子还借初审失败之机，在美国和中国各自建立了一个为他吸金的组织。这两个组织在自己的纲领性文件中明确表示，吸取的金钱将主要用于方舟子 与肖传国打官司。事实上，这两个吸金机构，位于中国的“科技打假资金”一个是非法组织，从事的是非法活动；而位于美国的“中国科学与学术诚信基金会”则是 一个彻头彻尾的骗子组织。（见本书第五章《吸金》） 

九、就在方氏海外基金会成立之后不到半个月，方舟子就伙同他的“免费”、“公益”律师彭剑从中洗走三万八千多元人民币。（见本书第五章《吸金》） 

十、方氏海内基金会的帐号是方舟子贴身律师彭剑的私人帐号、联系电话是他的私人电话。至今，该基金会没有公布资金的走向。至少有两万元人民币去向不明。（见本书第五章《吸金》） 

十一、2006年9月，方舟子怂恿美国西北大学教授饶毅撰写诋毁、诽谤肖传国的文章，并且在新语丝网站发表。肖传国随后在美国联邦法院控告饶毅，最后以饶毅向肖传国赔偿一万美元庭外了结。（见本书第六章《阿歪》） 

十二、2007年2月，方舟子利用传递公司向自己送交美国法庭传票的机会，制造了一个“恐吓信”事件，诬指保健品厂商对他进行威胁。方舟子制造 “恐吓信”事件的目的是炒作他的新书《科学成就健康》。2010年9月，也就是在事发三年半之后，方舟子自己承认那个事件就是传递公司送达法庭传票。方舟 子曾经报假案这个事实直接导致人们对他2010年报案被袭产生怀疑。（见本书第三章《逃讼》） 

十三、从2007年2月到2009年8月，方舟子为了逃避武汉法院的判决，暂时停止了对肖传国表面上的攻击。但是，受方氏海内资金会的资助，方舟 子的私人律师彭剑对肖传国及郑州神源医院的病人进行了非法的暗中调查，搜集黑材料。（神源医院是应用“肖氏手术”治疗脊柱裂病人的专门医院。）（见本书第 七章《行恶》） 

十四、2009年8月，武汉法院方面到北京依法执行了三年前的判决，从方舟子妻子的帐号上划走罚款及利息四万余元。方舟子对肖传国及武汉法院的谩骂和攻击马上重新开始，他并且怂恿、指使不满患者控告神源医院。（见本书第七章《行恶》） 

十五、从2009年10月起，方舟子勾结自己在新闻媒体的同伙，密谋策划了围剿、诽谤、陷害肖传国的行动。这场围剿行动共有《科学新闻》等四家媒 体参加，发表文章14篇，前后持续了半年的时间。事实表明，这场围剿的幕后总策划就是方舟子，前台指挥是方玄昌、贾鹤鹏，领衔主演是方舟子律师彭剑、方舟 子的密友纪小龙等人。（见本书第八章《作伥》） 

十六、新闻媒体对肖传国围剿的实质，就是把方舟子、彭剑对肖传国及神源医院病人的非法调查结果公布出来，其最终目标是要把肖传国定性为“中国的黄禹锡”。（见本书第八章《作伥》） 

十七、从2009年11月起，方舟子指使、怂恿自己的信徒到美国的脊柱裂和脊柱损伤医护网站散布自己制造的“肖氏手术”无效、致残的谣言。其目 的，就是要给美国政府支持的对肖氏手术的深入研究制造障碍。他们的所作所为激起了美国病人、病人家属、以及专业人员的强烈愤慨和极端鄙视，他们很快就被赶 出论坛。（见本书第七章《行恶》） 

十八、2010年2月，方舟子指使自己的信徒向美国政府邮寄匿名检举信件，对肖传国本人及 “肖氏手术”进行恶毒攻击。该检举信遭到美国卫生部相关部门的严辞驳回。（见本书第七章《行恶》） 

十九、2010年6月，方玄昌在北京被袭。方舟子马上暗示此案与肖传国有关。（见本书第八章《作伥》） 

二十、2010年8月，方舟子在北京被袭。方舟子的贴身律师彭剑马上明示肖传国是嫌疑人。（见中国媒体的相关报道，如中广网北京8月29日消息《方舟子律师：被袭可能是两方面人所为》，9月1日《南方周末》《“方舟子是中国树敌最多的人”》）。