在年度SCI论文发表数量上,中国科学院26921和美国加州大学31479有一拼，分别排第一和第二(2013年)。两家机构发表论文数量占国际全部数量的4.7%，可以代表国际学术发展的趋势。一个是国际头号科技强国最大的学术组织，另一个是国际科技大国的最大学术组织。学科分类虽然有区别，中国科学院在材料科学、地质、光学和植物学方面有比较强的优势，加大在神经科学、细胞生物学和天文学领域有更突出的表现，两家机构在物理化学等方面都比较强大（表6，7）。比较两大学术组织论文发表情况，也许可以窥探中美学术论文发表方面存在的差距和不同特点。
从发表论文杂志的情况看，除第一个Plos One以外，两大学术机构发表论文的杂志完全不同，美国加州大学在国际著名牛刊频繁发表论文，最著名的期刊例如PNAS、Nature、Science全部进入发表论文最多的杂志。而中国科学院发表论文最多的25本杂志似乎都不够档次。在国际著名四大综合期刊发表论文的数量，加洲大学分别为PNAS 561篇、Nature 193篇、Science 160篇和Cell 74篇。中国科学院分别为PNAS 86篇、Nature 37篇、Science 28篇和Cell 8篇。加洲大学显然远远超过中国科学院。比较有意思的是，加州大学发表的论文集中度并不大，年度发表超过100篇的杂志只有16本，而中国科学院则有32本杂志论文数量都超过100篇，说明两个机构在发表论文方面存在有意思的现象。在著名期刊中中国科学院学者特别偏爱的一个杂志是SCIENTIFIC REPORTS发表论文202篇（9），远远超过加州大学的114篇（14），这个可能说明一个问题，我们的科学家追求著名期刊的心情难得可贵，虽然这个期刊算不上特别牛，但出身高贵，前景光明。另外一个类似情况的杂志NATURE COMMUNICATIONS加州大学发表89，而中国科学院发表 67篇，比例适当。
从国际合作情况看，中国科学院和美国学者合作的比例确实比较高，但和其他国家合作的比例相对比较低，而美国加大和众多科技强国合作的程度非常高，这显然是由于大家都更愿意和美国学者合作的意向决定，在这方面是我们需要特别加强的。
表1.前5名发表论文最多的国际学术机构
机构扩展 记录 % of 1236967
1. UNIVERSITY OF CALIFORNIA SYSTEM 31479 2.545
2. CHINESE ACADEMY OF SCIENCES 26921 2.176
3. HARVARD UNIVERSITY 17311 1.399
4. UNIVERSITY OF LONDON 16013 1.295
5. RUSSIAN ACADEMY OF SCIENCES 13615 1.101
表2加州大学发表论文最多的25本杂志
来源出版物 记录 % of 31481
1. PLOS ONE 1022 1.766
2. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 561 0.969
3. ASTROPHYSICAL JOURNAL 453 0.783
4. PHYSICAL REVIEW LETTERS 304 0.525
5. PHYSICAL REVIEW B 268 0.463
6. PHYSICAL REVIEW D 223 0.385
7. JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 212 0.366
8. APPLIED PHYSICS LETTERS 203 0.351
9. MONTHLY NOTICES OF THE ROYAL ASTRONOMICAL SOCIETY 203 0.351
10. NATURE 193 0.333
11. JOURNAL OF NEUROSCIENCE 173 0.299
12. SCIENCE 160 0.276
13. JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY115 0.199
14. SCIENTIFIC REPORTS 114 0.197
15. JOURNAL OF HIGH ENERGY PHYSICS 111 0.192
16. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 108 0.187
17. ASTROPHYSICAL JOURNAL LETTERS 98 0.169
18. JOURNAL OF GEOPHYSICAL RESEARCH SPACE PHYSICS 94 0.162
19. JOURNAL OF APPLIED PHYSICS 92 0.159
20. ENVIRONMENTAL SCIENCE TECHNOLOGY 89 0.154
21. NATURE COMMUNICATIONS 89 0.154
22. JAMA INTERNAL MEDICINE 84 0.145
23. PHYSICS OF PLASMAS 83 0.143
24. NANO LETTERS 82 0.142
25. PLOS GENETICS 81 0.140
表3中国科学院发表论文的前25本杂志
来源出版物 记录 % of 26921
1. PLOS ONE 673 2.500
2. APPLIED PHYSICS LETTERS 288 1.070
3. CHEMICAL COMMUNICATIONS 284 1.055
4. RSC ADVANCES 258 0.958
5. ACTA PHYSICA SINICA 225 0.836
6. CHINESE SCIENCE BULLETIN 224 0.832
7. JOURNAL OF MATERIALS CHEMISTRY A 220 0.817
8. JOURNAL OF APPLIED PHYSICS 213 0.791
9. SCIENTIFIC REPORTS 202 0.750
10. NANOSCALE 184 0.683
11. CRYSTENGCOMM 176 0.654
12. CHINESE PHYSICS B 165 0.613
13. ACS APPLIED MATERIALS INTERFACES 158 0.587
14. PHYSICAL REVIEW D 151 0.561
15. ASTROPHYSICAL JOURNAL 149 0.553
16. JOURNAL OF ALLOYS AND COMPOUNDS 138 0.513
17. OPTICS EXPRESS 137 0.509
18. CHINESE PHYSICS LETTERS 133 0.494
19. CHEMISTRY A EUROPEAN JOURNAL 129 0.479
20. DALTON TRANSACTIONS 125 0.464
21. CHINESE JOURNAL OF GEOPHYSICS CHINESE EDITION 123 0.457
22. ANGEWANDTE CHEMIE INTERNATIONAL EDITION 122 0.453
23. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY C 121 0.449
24. SPECTROSCOPY AND SPECTRAL ANALYSIS 118 0.438
25. JOURNAL OF MATERIALS CHEMISTRY C 116 0.431
41. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 86 0.319
表4中国科学院国际合作论文情况
国家/地区 记录 % of 26921
PEOPLES R CHINA 26921 100.000
USA3503 13.012
GERMANY 986 3.663
JAPAN 784 2.912
ENGLAND 781 2.901
AUSTRALIA 740 2.749
CANADA593 2.203
FRANCE 555 2.062
ITALY 392 1.456
TAIWAN 376 1.397
表5. 加大国际合作论文情况
国家/地区 记录 % of 31481
USA31481 100.000
PEOPLES R CHINA 2296 7.293
GERMANY 2293 7.284
ENGLAND 2069 6.572
CANADA1832 5.819
FRANCE 1565 4.971
ITALY 1311 4.164
AUSTRALIA 1151 3.656
JAPAN 1111 3.529
SPAIN 1070 3.399
表6 加大10大研究方向
研究方向 记录 % of 31482
PHYSICS 3442 10.933
SCIENCE TECHNOLOGY OTHER TOPICS2924 9.288
NEUROSCIENCES NEUROLOGY 2331 7.404
CHEMISTRY 2266 7.198
ENGINEERING2043 6.489
BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY 1990 6.321
ENVIRONMENTAL SCIENCES ECOLOGY1566 4.974
ASTRONOMY ASTROPHYSICS 1386 4.403
MATERIALS SCIENCE 1292 4.104
CELL BIOLOGY 1083 3.440
表7 中国科学院10大研究方向
研究方向 记录 % of 26930
CHEMISTRY 6337 23.531
PHYSICS 5153 19.135
MATERIALS SCIENCE 3786 14.059
SCIENCE TECHNOLOGY OTHER TOPICS2739 10.171
ENGINEERING2535 9.413
ENVIRONMENTAL SCIENCES ECOLOGY1994 7.404
BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY 1253 4.653
GEOLOGY 1170 4.345
OPTICS 1127 4.185
PLANT SCIENCES 845 3.138
