正文中引用的文献一定要与文后参考文献列表中的文献相对应，会议摘要、会议论文集、个人通信等未公开发表信息，期刊一般不出现在文献列表中。如果某篇论文已被期刊录用但还未印刷出版，可将其列入文献列表，提供作者姓名、标题、期刊名（如有卷号，也标上），最后标明“(in press)”。如果某篇论文已投给某个期刊，但还未被录用，通常不应列入文献列表；如果列入这类文献，提供作者姓名、稿件的年份、标题，最后标明“Manuscript submitted forpublication”或“Submitted to XXXX”。
大多数期刊的文献引用都有自己的体例格式，稿件写作时务必要仔细查看目标期刊的作者须知，遵照其要求编排文献。关于文献编排体例的细节包括：是否列出文章标题，是否列出起止页码，作者姓名首字母的位置（在姓前面或后面），出版年份的位置（在作者姓名后面，期刊名后面，或本条文献最后），以及标点符号的使用，等等。电脑程序可以实现以各种体例编排文献（EndNote或Reference Manager）。注意在文献列表中，通常采用姓前名后，姓全拼、名缩写为首字母的形式。
一般来说，文后的文献列表里的期刊名使用缩写形式（具体取决于目标期刊的体例要求）。
Bailey, S.E., Olin, TJ., Bricka,R.M. and Adrian, D.D. (1999). A review of potentially low-cost sorbents forheavy metals. Water Res. 33:2469-2479.
Das, N.C. and Bandyopadhyay, M.(1992). Removal of copper (II) using vermiculite. Water Environ. Res. 64:852-857.
Hani, H. (1990). The analysis ofinorganic pollutants in soil with special regard to their bioavailability. J.Environ. Anal. Chem.39:197-208.
Lackovic, K, Angoe, M.J., Wells,J.D. and Johnson, B.B. (2004). Modelling the adsorption of Cd(II) onto goethitein the presence of citric acid. J. Colloid Interface Sci. 269:37-45.
1. Lackovic, K., Angove, M.J.Wells, J.D. and Johnson, B.B. (2004). Modellin the adsorption of Cd(II) ontogoethite in the presence of citric acid. J. Colloid Interface Sci. 269:37-45.
2. Bailey, S.E., Olin, T.J., Bricka,R.M., and Adrian, D.D. (1999). A review of potentially low-cost sorbents forheavy metals. Water Res. 33:2469-2479.
3. Hani, H. (1990). The analysisof inorganic pollutants in soil with special regard to their bioavailability.J. Environ. Anal. Chem. 39:197-208.
4. Das, N.C. and Bandyopadhyay,M. (1992). Removal of copper (II) using vermiculite. Water Environ. Res.64:852-857.
期刊通常不希望出现脚注或尾注，因为这会增加印刷的成本。但图表里的脚注是例外。如果仍然有必要添加说明性的注释，则可在标点符号或作者姓名之后插入数字上标。
示例：
Solange Brault* and Hal Caswell*
把所有脚注列在数字或符号上标所出现页面的底端：
* Order of authorship determined by toss of a coin.
摘编自《科技写作与交流》(任胜利等译. 科学出版社, 2012年出版)
