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材料与方法主要是说明研究所用的材料、方法和研究的基本过程。它回答“怎样做”的问题，起承上启下的作用。材料是表现研究主题的实物依据方法是指完成研究主题的手段。材料与方法是科技论文的基础是判断论文科学性、先进性的主要依据。它可以使读者了解研究的可靠性也为别人重复此项研究提供资料。
材料与方法的标题因研究的类型不同而略有差别调查研究常改为“对象与方法”临床试验则用“病例与方法”。不同类型研究的材料与方法的写作也不完全一样。实验研究要交待实验条件和实验方法。
① 实验条件包括实验动物的来源、种系、性别、年龄、体重、健康状况、选择标准、分组方法、麻醉与手术方法、标本制备过程以及实验环境和饲养条件等。
② 实验方法包括所用仪器设备及规格、试剂、操作方法。
③ 试剂如系常规试剂则说明名称、生产厂家、规格、批号即可，如系新试剂还要写出分子式和结构式，若需配制则应交待配方和制备方法。
④ 操作方法如属前人用过的，众所周知的，只要交待名称即可。如系较新的方法则应说明出处并提供参考文献，对某方法进行了改进则要交待修改的根据和内容，对创新的方法要注意不要将新方法的介绍和运用该方法研究的新问题混在一篇论文中，若论文系报道新方法则应详细的介绍试剂的配置和操作的具体步骤，以便他人学习和推广。
临床研究的对象是病人，应说明来自住院或门诊，同时必须将病例数、性别、年龄、职业、病因、病程、病理诊断依据、分组标准、疾病的诊断分型标准、病情和疗效判断依据、观察方法及指标等情况作简要说明。上述内容可根据研究的具体情况加以选择说明并突出重点。
① 对研究新诊断方法的论文：要注意交代受试对象是否包括了各类不同患者病情轻重、有无合并症、诊疗经过等受试对象及对照者的来源，如不同级别的医院某病患病率及就诊率可能不同，正常值如何规定，该诊断方法如何具体进行等等。
② 研究疾病临床经过及预后的论文：要注意说明病人是在病程的哪一阶段接受治疗，病人的转诊情况，是否制定了观察疾病结果的客观标准。
③ 病因学研究论文则要交代所用研究设计方法：如临床随机试验、队列研究等是否做剂量 - 效应观察。
④ 对临床疗效观察研究来说：主要说明病例选择标准，病例的一般资料，如年龄、性别、病情轻重等，分组原则与样本分配方法，配对、配伍或完全随机，疗效观察指标和疗效标准。
⑤ 治疗方法如系手术：应注明手术名称、术式、麻醉方法等，如系药物治疗则应注明药物的名称，一般用学名而不用商品名、来源，包括批号、剂量、施加途径与手段、疗程，中草药还应注明产地与制剂方法。 在材料与方法中，还应简要的说明在什么条件下使用何种统计处理方法与显著性标准，必要时应说明计算手段和软件名称。
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